Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALCAMQ13740 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALCAMQ13740 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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