Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTCH1Q13635 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTCH1Q13635 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms