Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSTA3Q13630 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSTA3Q13630 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms