Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4AQ13619 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms