Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTMR3Q13615 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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