Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AC002076.1-201ENST00000435257 527 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AL391863.1-201ENST00000422776 743 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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