Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CHAF1BQ13112 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CHAF1BQ13112 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CHAF1BQ13112 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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