Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXF2Q12947 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXF2Q12947 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXF2Q12947 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXF2Q12947 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXF2Q12947 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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FOXF2Q12947 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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