Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRJQ12913 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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