Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
STX4Q12846 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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STX4Q12846 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
STX4Q12846 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
STX4Q12846 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
STX4Q12846 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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