Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFFO1Q0D2I5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms