Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms