Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms