Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL359873.1-201ENST00000447908 764 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CTHRC1-203ENST00000520337 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 B2M-202ENST00000544417 933 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC245519.2-201ENST00000633673 475 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 LINC00525-201ENST00000412730 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC008443.1-204ENST00000417281 629 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC009090.1-201ENST00000562409 358 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNB1Q02641 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms