Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms