Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OC90Q02509 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
OC90Q02509 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
OC90Q02509 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
OC90Q02509 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
OC90Q02509 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
OC90Q02509 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OC90Q02509 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OC90Q02509 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OC90Q02509 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OC90Q02509 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OC90Q02509 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OC90Q02509 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OC90Q02509 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OC90Q02509 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OC90Q02509 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms