Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BNC1Q01954 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms