Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFITM3Q01628 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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