Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BEX3Q00994 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEX3Q00994 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEX3Q00994 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEX3Q00994 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEX3Q00994 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEX3Q00994 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEX3Q00994 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BEX3Q00994 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEX3Q00994 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEX3Q00994 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEX3Q00994 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BEX3Q00994 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms