Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MDM2Q00987 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms