Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2BQ00403 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms