Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMF1P82094 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMF1P82094 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMF1P82094 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMF1P82094 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMF1P82094 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms