Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms