Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RIPK4P57078 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPK4P57078 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms