Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN12P56749 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN12P56749 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN12P56749 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN12P56749 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN12P56749 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN12P56749 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN12P56749 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN12P56749 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN12P56749 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN12P56749 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN12P56749 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN12P56749 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN12P56749 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms