Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SH3BGRP55822 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms