Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRPF1P55201 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRPF1P55201 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms