Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACLYP53396 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACLYP53396 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACLYP53396 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACLYP53396 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACLYP53396 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACLYP53396 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACLYP53396 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACLYP53396 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACLYP53396 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACLYP53396 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACLYP53396 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms