Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGDP52209 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGDP52209 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGDP52209 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGDP52209 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGDP52209 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGDP52209 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGDP52209 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGDP52209 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGDP52209 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGDP52209 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGDP52209 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGDP52209 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGDP52209 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGDP52209 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGDP52209 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGDP52209 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGDP52209 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGDP52209 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGDP52209 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PGDP52209 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PGDP52209 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGDP52209 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms