Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DAP3P51398 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DAP3P51398 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DAP3P51398 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms