Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM4P49221 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM4P49221 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms