Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AFMP43652 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AFMP43652 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AFMP43652 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AFMP43652 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AFMP43652 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AFMP43652 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms