Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGER3P43115 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGER3P43115 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms