Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP2P42575 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP2P42575 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP2P42575 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP2P42575 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP2P42575 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP2P42575 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP2P42575 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP2P42575 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP2P42575 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP2P42575 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP2P42575 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CASP2P42575 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASP2P42575 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP2P42575 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP2P42575 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP2P42575 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP2P42575 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP2P42575 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP2P42575 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP2P42575 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP2P42575 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP2P42575 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP2P42575 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP2P42575 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP2P42575 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP2P42575 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP2P42575 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP2P42575 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP2P42575 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP2P42575 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms