Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFNP31947 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFNP31947 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFNP31947 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SFNP31947 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms