Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC13P31276 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms