Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA11P31270 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms