Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HOXA9P31269 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXA9P31269 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms