Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CNGA1P29973 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms