Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EPHA3P29320 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms