Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD34P28906 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD34P28906 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD34P28906 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms