Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXD10P28358 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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