Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms