Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRGP23470 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms