Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA1P23193 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms