Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGFR4P22455 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGFR4P22455 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms