Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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RAB5AP20339 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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RAB5AP20339 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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RAB5AP20339 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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RAB5AP20339 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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RAB5AP20339 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB5AP20339 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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