Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXB9P17482 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms