Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD8P13378 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms