Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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